南京是中国近代教育的重要发源地，建学堂、采西技、开民智、启童蒙，率先创办新式学校，涌现了一批教育改革实践家。郭秉文在南京高等师范学校（后改名为东南大学）推行教育改革，陶行知在南京开展平民教育和乡村教育，陈鹤琴创办了中国第一个实验幼儿园，俞子夷在南京高等师范学校附属小学开展各类教学法实验改革。教育管理机构不断改革完善，促进了南京初等教育、中等教育、高等教育、职业教育、师范教育的迅速发展。

《南京近代教育档案》是由南京市档案馆承担的国家档案局“十三五”国家重点档案保护与开发项目，历时3年编纂出版16册，包含从本馆馆藏中精选的一千余件档案。内容涵盖南京近代教育概况、教育计划、教育规程、教育经费、校舍建设等，以及在南京近代教育史上产生重要影响的著名中学档案，较为全面的揭示了南京近代教育的产生、发展及其深远影响。

该套丛书的出版，为南京近代教育史研究提供了宝贵的档案史料，丰富了相关学校的校史资料，受到了社会广泛关注，对开展具有地域特色的爱国主义教育起到了积极的推动作用，对国内同类项目的开发工作具有示范与指导意义。